慈福寺位于菩萨顶后门北300米，原名禅堂院，是菩萨顶下院，建于1814年(嘉庆十九年)最初是菩萨顶退职大喇嘛佐巴隆柱坐禅修持之所。1822年(道光二年)至1829年续建，1830年(道光九年)道光皇帝赐匾曰慈福寺。是章嘉活佛五寺之一。
米拉日吧殿
慈福寺寺院狭长幽深，建筑规模宏大，占地7826平方米，中轴线上建有天王殿、大雄宝殿、文殊殿和藏经殿，东西厢房为二层楼房各26间。
大雄宝殿为三开间，殿前建抱厦，拱券敦厚朴实，阑额绘满金色梵文，四面围以栏杆，为藏传佛教庙堂建筑风格。大佛殿内供铜铸接引佛像，体态丰盈，胸部突出，线条优美，面形丰满，眉目开朗，嘴角上翘，如发出会心的微笑。手在胸前作接引姿势，动感强烈，具有生活化的特点。这是阿弥陀佛接引众生往生西方净土之像。接引佛之后是1986年新塑的阿弥陀佛、释迎牟尼佛和药师佛。接引佛东侧有楼梯通向上层，内供七尊塑像:静命伦师、莲花生大师、赤松德赞、班布玛牟扎、萨班贡嘎坚赞、宗喀巴大师、龙轻饶将，都是藏传佛教的重要人物。
宋代铜接引佛
慈福寺还有一块《五台山圣境全图》印版，长162厘米，宽118厘米，厚15厘米，面积1.91平方米，系慈福寺喇嘛桑格阿麻格于1846年(道光二十六年)所雕，内容丰富，技艺精湛。上刻五台山清代中叶寺院丛林静室60余处，帝王行宫3处，佛塔灵迹30多处，并刻有奇峰、古柏、苍松等，是五台山的珍贵文物，现藏毛泽东路居纪念馆内。
寺西北有小殿3间，小巧玲珑，内供西藏18个成就者之一、白教祖师木拉日巴尊者(亦译为麦拉日瓦)，殿门刻帕思巴蒙文。这是五台山藏传佛教中唯一的白教祖师殿。
现在慈福寺主持是能戒大和尚，能戒师父毕业于中国佛学院，精通经律，兼任五台山佛教协会副会长。